Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XylbQ3TNA1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XylbQ3TNA1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms