Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3TEI4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3TEI4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms