Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms