Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms