Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q149G0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q149G0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q149G0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q149G0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q149G0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q149G0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q149G0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q149G0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q149G0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q149G0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q149G0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q149G0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms