Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms