Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms