Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms