Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a1Q00780 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col8a1Q00780 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms