Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx1P81068 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms