Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb1P70662 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms