Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stra8P70278 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms