Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbdsP70122 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms