Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta1P68134 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms