Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab1AP62821 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms