Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vbp1P61759 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms