Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ppfia3P60469 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms