Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms