Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdsp1P58466 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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