Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gsc2P56916 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gsc2P56916 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gsc2P56916 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gsc2P56916 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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