Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5eP56382 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms