Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GferP56213 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GferP56213 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GferP56213 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GferP56213 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms