Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp1P56183 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms