Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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