Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NodalP43021 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NodalP43021 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NodalP43021 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NodalP43021 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NodalP43021 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms