Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc3P33622 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms