Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc11P31313 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms