Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpbP27048 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpbP27048 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms