Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd19P25918 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd19P25918 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd19P25918 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd19P25918 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms