Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk1P22518 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms