Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klra1P20937 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klra1P20937 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms