Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou5f1P20263 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou5f1P20263 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms