Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P20040 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P20040 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P20040 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P20040 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P20040 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P20040 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P20040 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P20040 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P20040 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P20040 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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