Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxb1P17919 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb1P17919 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms