Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgfb3P17125 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgfb3P17125 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms