Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprqP0C5E4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprqP0C5E4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms