Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spta1P08032 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spta1P08032 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms