Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tom1O88746 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tom1O88746 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tom1O88746 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tom1O88746 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms