Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RradO88667 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RradO88667 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RradO88667 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RradO88667 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RradO88667 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RradO88667 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms