Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme6O88425 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme6O88425 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms