Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd83O88324 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd83O88324 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd83O88324 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms