Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt5hO55201 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt5hO55201 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms