Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SlkO54988 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SlkO54988 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SlkO54988 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SlkO54988 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SlkO54988 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SlkO54988 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SlkO54988 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms