Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf13O54965 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms