Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema6bO54951 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms