Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rab33bO35963 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rab33bO35963 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab33bO35963 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab33bO35963 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab33bO35963 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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