Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek2O35942 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek2O35942 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek2O35942 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms