Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited2O35740 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited2O35740 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms