Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f3O35261 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f3O35261 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f3O35261 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms