Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim18J3QNP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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